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连作条件下黄瓜根际微生物多样性研究

  • 简介: 原文 微生物是地球上最早出现的生命形式, 是生物中一群重要的分解代谢类群, 其作为生态系统中极重要的一员,对植物的生长、生态系统中的能流和物质循环及环境污染物的降解和解毒等方面起着重要作用。土壤是微生物生长和繁殖的良好系统,各种微生...
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原文

微生物是地球上最早出现的生命形式, 是生物中一群重要的分解代谢类群, 其作为生态系统中极重要的一员,对植物的生长、生态系统中的能流和物质循环及环境污染物的降解和解毒等方面起着重要作用。土壤是微生物生长和繁殖的良好系统,各种微生物都能在土壤中生活,素有“微生物大本营”之称,土壤微生物的最重要作用是分解动植的排泄物及残体,转化合成腐殖质,增强土壤肥力,促进土壤良好的结构的形成。
土壤中的微生物也是植物营养中的主要动力,依靠微生物对有机质的不断矿质过程,为植物源源不断地供应碳、氮、硫、磷等矿质营养,土壤中固氮微生物能固定空气中的氮气,为植物提供氮源,是自然界中氮素循环的重要环节。从全球看,每年生物固定的氮量约为工业生产的氮肥的3倍,有些土壤微生物还可以分解有毒物质或难以分解的特殊物质,可以起到净化环境的作用。
传统的土壤生态系统中微生物群落多样性及结构分析大多是将微生物进行分离培养,然后通过一般的生物化学性状,或者特定的表现型来分析,局限于从固体培养基上分离微生物。但随着人们对土壤中微生物的原位生存状态研究,越来越发现常规的分离培养方法很难全面地估价微生物群落多样性。从土壤中简单提取和平板培养计数不能得到土壤微生物在土壤生态系统中的生活特征和生态功能[8]的信息。纯培养方法和原理大多从医药微生物引过来的,有些方法对土壤微生物研究并不很适合,譬如在自然土壤生态环境下许多土壤微生物处于贫营养,而在实验室用营养丰富的牛肉汁蛋白胨来测定土壤活细菌的总数,大量的贫营养微生物不适宜生长,测定结果误差中存在高温型细菌,但土壤中的低大;一般实验室在分离培养土壤细菌时通常只是在28 ℃下培养。
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  目录

目录
中文摘要 ----------------------------------------------------------------------------I
英文摘要 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------II
前言 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1
1. 研究内容 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------2
2. 材料与方法 -------------------------------------------------------------------------------------------------------2
2.1 土壤样品及其采集-----------------------------------------------------------------------------------------2
2.2 DNA的抽提-----------------------------------------------------------------------------------------------3
2.3 DNA的纯化-----------------------------------------------------------------------------------------------3
2.4 DNA的PCR扩增----------------------------------------------------------------------------------------3
2.5 PCR产物的分离------------------------------------------------------------------------------------------3
3.结果与分析 -------------------------------------------------------------------------------------------------------3
3.1 DNA的提取结果------------------------------------------------------------------------------------------3
3.2 DNA的纯化结果------------------------------------------------------------------------------------------4
3.3 变形梯度电泳(DGGE)的结果与分析--------------------------------------------------------------5
4.讨论 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------5
参考文献 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------6


  参考资料

[1] Fisher SG et al.Proc Natl Acad Sci USA,1983,80:1579~1583
[2] Muyzer G, De Waal E C,Uitterlinden A G. Profiling of complex microbial population by denaturing gradient gelelectrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes encoding for 16SrRNA .Appl.Environ.Microbiol.,1993,59(3):695~700.
[3] Muyzer G. DGGE/TGGE a method for identifying genes from natural ecosystems. Curr. Microbiol., 1999,2:317~322.
[4] Edwards C. Environmental Monitoring of Bacterial[M]. Totowa ,New Jersey : Humana press,1999 .175~186.
[5] 中国科学院南京土壤研究所微生物室,土壤微生物研究法,科学技术出版社,1985
[6] Zhou J,Mary B,James M T. DNA recovery from soils of diverse composition. Appl. Environ. Microbial.,1996,62: 316~322.
[7] Smit E ,Leeflang P ,Gommans S , et al .Diversity and seasonaln fluctuations of the dominant members of the bacterial soil community in a wheat field as determined by cultivation and molecular methods [J]. Appl. Environ. Microbiol .,2001,67(5):2284-2291
[8] tenKate.GlobalBiodiversityForum.1995,Nov,Jakarta,4/5
[9] BanoNandHollibaughJT PhylogeneticCompositionofBacterioplanktonAs semblagesfromtheArcticOcean[J] ApplEnvironMicrobiol,2002,68(2):505-518
[10]HelmutB,ManuelP,FrancoW,etal.AstrategyforoptimizingqualityandquantityofDNAe


  简单介绍

摘要 土壤微生物被认为是连作障碍的主要因子,其群落结构组成及优势种群的变化在一定程度上反应了土壤的稳定性,更重要的是,土壤微生物群落结构和组成的多样性不仅提高了土壤生态系统的稳定性,同时也提高了土壤微生态系统对环境恶化的缓冲能力。由于微生物和大生物(动、植物)相比,存在着多种显著差异,因此其多样性研究、保护及利用也有所不同,尤其是研究方法亟待完善、提高。近年来,分子生物学方法广泛用于微生物多样性的研究并取得了一系列研究成果。本试验采用在微生物生态学领域广泛应用的变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术研究不同连作年限黄瓜根际细菌多样性,揭示连作对土壤微生物多样性的影响,为改善土壤环境条件,提高作物产量提供依据和奠定基础。

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