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硕士论文 阈性状遗传标记QTL连锁分析

  • 简介:硕士论文-阈性状遗传标记QTL连锁分析,共52页,29387字,摘要,数量性状基因座(QTL)的检测和准确定位是影响遗传评定准确性的重要因素,从,而也是制定育种方案时应用标记辅助选择(MAS)方法的前提,是大幅度加大畜禽选择遗,传进展的关
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适用专业:动物遗传育种与繁殖
适用年级:大学
论文编号:197612

论文简介:
硕士论文-阈性状遗传标记QTL连锁分析,共52页,29387字
摘要
数量性状基因座(QTL)的检测和准确定位是影响遗传评定准确性的重要因素,从
而也是制定育种方案时应用标记辅助选择(MAS)方法的前提,是大幅度加大畜禽选择遗
传进展的关键。因此,这方面的研究已经成为分子数量遗传学十分引人注目的研究课题。
影响 QTL 定位效果的因素很多,包括群体类型、规模、涉及的 QTL 数目、遗传标记的密
度、性状遗传力等等,特别是分析中使用的遗传和统计模型对 QTL 检测和定位有较大的
影响。在定位前,根据实际情况选择合适的定位方法有重要的意义。
阈性状作为特殊的遗传性状,大多具有较重要的经济价值。由于其遗传基础与普通
的数量性状相同,因此把它归于数量性状的研究领域。本文采用最大似然区间定位法对
阈性状的标记 QTL 进行连锁分析,并对影响阈性状 QTL 检测效率的主要因素(性状遗传
力、QTL 的方差贡献率、标记间重组率、阈值)进行了模拟研究。实验设计的群体为利
用标记座位和 QTL 座位上都为杂合子的公畜与来自随机平衡群体的母畜群交配产生的半
同胞个体组成,模拟产生的资源群体大小为 500 头。研究结果表明:当性状的遗传力较
高,QTL 方差贡献较大时,检验统计量 LR 值较大,检验效果较好;遗传力较低,QTL 方
差贡献较小时,LR 值较小,QTL 检测效果较差。另外,标记间重组率和阈值对 QTL 定位
的准确度也有直接的影响,随着标记间重组率的增大,QTL 定位的效果越差,当阈值在
0.2-5 之间时, QTL 检测效果最好。
关键词:阈性状;QTL 连锁;Monte-Carlo 方法;侧翼标记;最大似然区间定位法
目 录
目录
中文摘要 …
英文摘要 …
缩略语对照表………
前 言…….…
第一章 文献综述..…
1 QTL 研究概况…...….…...
1.1 QTL 定位的遗传学基础….……...
1.2 QTL 的遗传特征………
1.3 基因定位…….
1.3.1 连锁分析…..
1.3.2 遗传标记…….………
1.3.3 定位策略….
1.3.4 定位方法……….……
2 阈性状
2.1 阈性状的特征….………...
2.2 阈性状的分布..…….…
3 蒙特卡罗方法....
3.1 蒙特卡罗方法的定义.…
3.2 蒙特卡罗方法的步骤….
3.3 蒙特卡罗模拟……….....
3.3.1 设置系统参数……..........……….
3.3.2 作系统假设……….……..…..….
3.3.3 模拟试验…...………...
4 本研究的意义及应用前景……...…
4.1 标记辅助选择.…….
4.2 标记辅助导入…...
4.3 杂种优势的利用...………...
4.4 转基因育种.…
第二章 阈性状遗传标记 QTL 连锁分析……….
1 模型和方法…….....……...
1.1 群体类型.…...
1.2 性状的遗传模型….……….……...
1.3 统计分析……
1.4 模拟群体参数….……...
2 结果与分析……
2.1 性状遗传力对 QTL 定位的影响….
2.2 方差贡献率对 QTL 定位的影响….
2.3 标记间重组率对 QTL 定位的影响…..……..
2.4 阈值对 QTL 定位的影响………...
3.讨 论.... …. …...
3.1 QTL 位点上基因相同的概率……
3.2 阈性状的 QTL 连锁分析
结 论….
参考文献………...
致 谢….


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